sig
  type t
  val qname : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> string option
  val flags :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> Biocaml_sam.Flags.t Core.Std.Or_error.t
  val rname :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_bam_alt.Header.t -> string option Core.Std.Or_error.t
  val pos : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> int option
  val mapq : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> int option
  val cigar :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_sam.cigar_op list Core.Std.Or_error.t
  val rnext :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_bam_alt.Header.t -> Biocaml_sam.rnext option Core.Std.Or_error.t
  val pnext : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> int option
  val tlen : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> int option
  val seq : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> string option
  val qual :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_phred_score.t list Core.Std.Or_error.t
  val optional_fields :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_sam.optional_field list Core.Std.Or_error.t
  val decode :
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t ->
    Biocaml_bam_alt.Header.t -> Biocaml_bam_alt.alignment Core.Std.Or_error.t
  val encode :
    Biocaml_bam_alt.alignment ->
    Biocaml_bam_alt.Header.t ->
    Biocaml_bam_alt.Alignment0.t Core.Std.Or_error.t
  val t_of_sexp : Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam_alt.Alignment0.t
  val sexp_of_t : Biocaml_bam_alt.Alignment0.t -> Sexplib.Sexp.t
end