sig
  type raw_bam_error =
      [ `read_name_not_null_terminated of string
      | `reference_information_name_not_null_terminated of string
      | `reference_information_overflow of int * string
      | `wrong_int32 of string
      | `wrong_magic_number of string ]
  val string_to_raw :
    ?zlib_buffer_size:int ->
    unit ->
    (string,
     (Biocaml_bam.raw_item,
      [> `bam of Biocaml_bam.Transform.raw_bam_error
       | `unzip of Biocaml_zip.Transform.unzip_error ])
     Core.Result.t)
    Biocaml_transform.t
  type parse_optional_error =
      [ `wrong_auxiliary_data of
          [ `array_size of int
          | `null_terminated_hexarray
          | `null_terminated_string
          | `out_of_bounds
          | `unknown_type of char
          | `wrong_int32 of string ] * string ]
  val parse_optional :
    ?pos:int ->
    ?len:int ->
    string ->
    (Biocaml_sam.optional_content,
     Biocaml_bam.Transform.parse_optional_error)
    Core.Result.t
  type parse_cigar_error =
      [ `wrong_cigar of string | `wrong_cigar_length of int ]
  val parse_cigar :
    ?pos:int ->
    ?len:int ->
    string ->
    (Biocaml_sam.cigar_op array, Biocaml_bam.Transform.parse_cigar_error)
    Core.Result.t
  type raw_to_item_error =
      [ `header_line_not_first of int
      | `header_line_without_version of (string * string) list
      | `header_line_wrong_sorting of string
      | `invalid_header_tag of int * string
      | `invalid_tag_value_list of int * string list
      | `reference_sequence_not_found of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_auxiliary_data of
          [ `array_size of int
          | `null_terminated_hexarray
          | `null_terminated_string
          | `out_of_bounds
          | `unknown_type of char
          | `wrong_int32 of string ] * string
      | `wrong_cigar of string
      | `wrong_cigar_length of int
      | `wrong_flag of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_mapq of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_pnext of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_pos of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_qname of Biocaml_bam.raw_alignment
      | `wrong_tlen of Biocaml_bam.raw_alignment ]
  val raw_to_item :
    unit ->
    (Biocaml_bam.raw_item,
     (Biocaml_sam.item, [> Biocaml_bam.Transform.raw_to_item_error ])
     Core.Result.t)
    Biocaml_transform.t
  type item_to_raw_error =
      [ `cannot_get_sequence of Biocaml_sam.alignment
      | `header_line_not_first of string
      | `reference_name_not_found of Biocaml_sam.alignment * string ]
  val item_to_raw :
    unit ->
    (Biocaml_sam.item,
     (Biocaml_bam.raw_item, Biocaml_bam.Transform.item_to_raw_error)
     Core.Result.t)
    Biocaml_transform.t
  val raw_to_string :
    ?zlib_buffer_size:int ->
    unit -> (Biocaml_bam.raw_item, string) Biocaml_transform.t
  val raw_bam_error_of_sexp :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.raw_bam_error
  val raw_bam_error_of_sexp__ :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.raw_bam_error
  val sexp_of_raw_bam_error :
    Biocaml_bam.Transform.raw_bam_error -> Sexplib.Sexp.t
  val parse_optional_error_of_sexp :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.parse_optional_error
  val parse_optional_error_of_sexp__ :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.parse_optional_error
  val sexp_of_parse_optional_error :
    Biocaml_bam.Transform.parse_optional_error -> Sexplib.Sexp.t
  val parse_cigar_error_of_sexp :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.parse_cigar_error
  val parse_cigar_error_of_sexp__ :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.parse_cigar_error
  val sexp_of_parse_cigar_error :
    Biocaml_bam.Transform.parse_cigar_error -> Sexplib.Sexp.t
  val raw_to_item_error_of_sexp :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.raw_to_item_error
  val raw_to_item_error_of_sexp__ :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.raw_to_item_error
  val sexp_of_raw_to_item_error :
    Biocaml_bam.Transform.raw_to_item_error -> Sexplib.Sexp.t
  val item_to_raw_error_of_sexp :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.item_to_raw_error
  val item_to_raw_error_of_sexp__ :
    Sexplib.Sexp.t -> Biocaml_bam.Transform.item_to_raw_error
  val sexp_of_item_to_raw_error :
    Biocaml_bam.Transform.item_to_raw_error -> Sexplib.Sexp.t
end